购买房屋时的初期费用主要包括：

1. 中介手续费：房产交易达成时，向房产中介支付的手续费，统一为房价的3%+6万日元。

2. 房产取得税：登记土地或建筑物的所有权、转移以及其他法律权利时，缴纳的登记税费。这是为了公告该不动产的地址、所有者姓名、权利关系等资料。登记费用为土地固定资产评估额×2%+建筑固定资产评估额×2%。

3. 司法书士的手续费：材料整理、房产所有权转移需要由司法书士办理，手续费为6至10万日元。

4. 合同印花税：在日本每一份攸关商业交易的合约中，都必须贴上印纸来作为课税凭证，印花税由此而来。房产买卖合同所需的印花税约为5000至10000日元。

5. 保险费：火灾和地震保险，可以根据需要自选保险项目。